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Postdoctoral Opportunity
on
mosquito metabolomics
at
MIVEGEC
IRD Montpellier
France

 

Mosquitoes are the deadliest animals on earth due to their ability to transmit deadly and life-debilitating pathogens. Dengue virus is the most prevalent arthropod-borne virus as it infects about 400 millionpeople yearly and threatens half of the human world population. Unfortunately, there are neither efficient vaccine nor therapeutics and vector control has moderate effect on epidemics.

 

We recently developed a novel approach based on metabolomics applied to mosquito vector competence (Vial et al. PLoS Pathogens, 2019; doi: 10.1371/journal.ppat.1008199; Vial et al. PNAS, 2020; doi: 10.1073/pnas.2015095117). By combining mosquito metabolomics with molecular entomology and cell biology, we discovered how and why dengue virus reconfigures phospholipids in mosquitoes. This improved understanding of how viruses hijack the host metabolome will be useful to develop novel intervention strategies.

 

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Contact MiVEGEC : Julien POMPON

 

 

 

 

 

 

Contrat à durée déterminée 18mois
Chargé de projet H/F
Projet Européen :
MediLabSecure
Catégorie A – Assistant Ingénieur (AI)

 

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Le projet MediLabSecure

MediLabSecure coordonné par l’Institut Pasteur met en réseau 22 pays bénéficiaires non-membres de l’Union Européenne, dans la zone Méditerranée et Sahel. Avec une approche "One Health", ce réseau s’intéresse aux maladies virales émergentes et a pour objectif d’améliorer la préparation et la réponse à ce type de menaces.

 

Mission

La personne recrutée sera chargée de la bonne avancée du projet. Elle œuvrera sous la responsabilité du responsable du WP Entomologie, également membre de l’Unité MIVEGEC de l’IRD.

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Le dossier de candidature (CV et lettre de motivation; éventuellement lettre de recommandation) est à transmettre aux deux adresses électroniques suivantes:

This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. et This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

Date de parution du poste : 29 octobre 2020

Date limite pour candidater : 29 novembre 2020

Prise de fonction : début janvier 2021

Contact MIVEGEC : Vincent ROBERT

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Assistant(e) en Entomologie médicale, laboratoire et terrain
La Réunion
AI – Assistant Ingénieur

 

CDD de 12 mois non renouvelable à compter du 15 septembre 2020

 

Missions

L’assistant(e) ingénieur(e) apportera un appui technique au développement et à la mise en œuvre des essais semi-field et terrains de l’approche TIS renforcée contre les moustiques Aedes à La Réunion, notamment à travers des suivis entomologiques longitudinaux, l’évaluation des indicateurs de qualité et des indicateurs d’efficacité des interventions. Il pourra être amené à participer à d’autres activités de recherche menées en entomologie médicale et vétérinaire au laboratoire et sur le terrain par l’équipe de l’UMR Astre à La Réunion.

 

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Date de clôture pour candidater: 31 juillet 2020

Date de prise poste souhaitée : 15 septembre 2020

 

CONTACT : Louis Clément GOUAGNA

 

 

 

 

 


The combined effect of plastics and parasites on the population dynamics of seabird populations

 

Deadline application : 06/07/2020

 

A 3 year doctoral contract funded by the CNRS's mission for transversal and interdisciplinary initiatives (MITI) is available to study the combined impact of plastics and parasites on the seabird population dynamics and disease emergence. This project combines field-based observational approaches with genetic, demographic and chemical analyses. The start date of the contract is set for 1 October 2020.

For more information, please consult the following link: https://bit.ly/3eZBQAy

The candidate will be chosen based on merit following an interview before a selection committee  (by videoconference), without regard to age, origin, sex, religion, sexual orientation or any other personal characteristic unrelated to the candidate's professional performance.

 

Contact Mivegec : Karen McCoy



 

4 postes de technicien laboratoire/terrain en CDD

 

Quatre postes sont ouverts au recrutement en cette fin d'année. Technicien de laboratoire et de terrain, assistant de terrain et chargé de communication sont recherchés pour participer au projet de développement de la technique de l'insecte stérile sur l'île de la Réunion.

 

> voir / télécharger les annonces ici

 

Candidatures à envoyer à Louis-Clément Gouagna avant le 31 décembre 2019.

 

 

 

Post-doctoral position at IRD in Montpellier (France):
Statistical analysis of the impact of Vector Control on the course of the dengue epidemic in Reunion Island in 2018-2019

 

A 1-year post-doctoral position funded by the ANSES (French Agency for Food, Environmental and Occupational Health & Safety) is available for a highly motivated young researcher at the Research Unit MIVEGEC (Infectious Diseases and Vectors: Ecology, Genetics, Evolution and Control) at the IRD (Institut de Recherche pour le Développement) in Montpellier, France.

The postdoc post will focus on the statistical analysis of the efficacy of vector control actions targeted against Aedes albopictus on the course of the dengue epidemic in Reunion Island in 2018-2019. The aim is to use data collected locally (epidemiological data, vector control data) and analyze them in order to study the effectiveness of certain Aedes control actions on the course of the dengue epidemic in La Reunion Island during 2018-2019.

The activities will consist of statistical analysis of field data in close collaboration with the project supervisor (David Roiz, CRCN IRD MIVEGEC). Descriptive analysis of retrospective and geo- referenced databases. Collect additional data. Develop and validate the statistical analyses (to be defined, for example: Generalized Linear Model (GLM), Generalized Additive Model (GAM), time series). Writing and submission of a scientific publication.

The competences required are: Statistical analysis and programming (ex: software R). Spatial modeling (ex: R and QGIS / ArcGIS). Spatial ecology or population ecology (eg vectors, mosquitoes in general, Aedes genus). The candidate must hold a PhD presented within the last two years.

The post will be for 1 year (12 months) beginning in November 2019 with a net salary of around 2200 euros in Montpellier, France. MIVEGEC is a reference research unit for disease ecology and vector- borne diseases and Montpellier an important research pole center.

Applicants should send a brief summary of research activities, a CV, a list of publications, and the names and e-mail addresses of two referees to David Roiz (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.). Deadline for submission October 20, 2019.

 

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https://www.mivegec.ird.fr/en/
https://en.ird.fr/
https://scholar.google.ca/citations?user=TYPnVQ0AAAAJ&hl=en

 

 

Deux postes de Technicien sur l’écologie et l’évolution de la malaria aviaire

 Poste #1 _CDD Technicien 1 an

 Laboratoire MIVEGEC (IRD, 911 avenue Agropolis, 34980 Montpellier)

Date du début : 1 Janvier 2020 (1 an, non prorogeable)

Financement : ANR EVODRUG

Encadrement : Ana Rivero

Contact :  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Description des missions :

Les recherches de notre équipe au MIVEGEC (Montpellier) portent sur l’écologie et l’évolution des interactions hôte-parasite en se focalisant sur le système expérimental malaria aviaire. Nous travaillons actuellement sur plusieurs projets qui incluent l'évolution de la résistance aux médicaments chez Plasmodium, la fréquence et l'impact des co-infections avec Trypanosoma et le développement de marqueurs moléculaires des gamétocytes de Plasmodium par single-cell transcriptomics.

Une partie importante du travail consistera à la mise en œuvre de protocoles de biologie moléculaire standards et de microscopie pour la détection et la quantification des parasites chez les hôtes et les vecteurs. Vous participerez également à la maintenance du système expérimental (travail en animalerie et insectarium), ainsi qu’à la réalisation d’expérimentations en collaboration avec d’autres membres de l’équipe.

 Compétences requises :

- Expérience pratique en laboratoire, de préférence dans le domaine des interactions hôte-vecteur-parasite (infections expérimentales,  suivi de traits d’histoire de vie).

- Connaissance des principales techniques de biologie moléculaire et de microscopie appliqués à la parasitologie (PCR, qPCR, rt-qPCR, microsatellites, séquençage, génotypages).

- Autonomie, sens de l’organisation et gestion du temps de travail.

Pour plus d’infos sur le poste, sur notre équipe ou sur les projets sur lesquels nous travaillons (ou pour n’importe quelle autre question) n’hésitez pas à me contacter.

 

Si cela vous intéresse, merci de m’envoyer par mail, avant le 15 Octobre 2019 :

- Votre CV (court svp, 2-3 pages max, avec un minimum d’acronymes)

- Une petite lettre de motivation (1 page) expliquant votre parcours et vos aspirations professionnelles.

- Le nom et l’adresse mail de 2 personnes qui connaissent bien votre travail (un ancien prof, ou employeur par exemple), en bien spécifiant quelle est votre relation professionnelle avec eux.

 Poste #2 _CDD Technicien 2 ans

Laboratoires CEFE (1919 route de Mende, 34293 Montpellier) et MIVEGEC (IRD, 911 avenue Agropolis, 34980 Montpellier)

Date du début : 1 Janvier 2020 (2 ans)

Financement : ANR EVOMALWILD (https://anr.fr/Projet-ANR-17-CE35-0012)

Encadrement : Sylvain Gandon

Contact :  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

Description du projet et des missions :

Le projet ANR EVOMALWILD explore la diversité phénotypiques et génétique de la malaria aviaire (parasite de genre Plasmodium qui infecte les oiseaux). Certaines lignées de malaria infectent de nombreuses espèces d’oiseaux alors que d’autres sont plus rares et spécialisées sur un nombre d’hôte limité. Comment expliquer la coexistence entre ces différentes lignées ? Est-il possible de caractériser le déterminisme génétique de la spécificité ? Pour répondre à ces question nous développons des approches expérimentales (infections de canaris et de moustiques dans des conditions de laboratoire) mais aussi génomiques (séquençage de différentes lignées de Plasmodium aviaire). Une partie importante du travail consistera à la mise en œuvre des protocoles de biologie moléculaire standards et de microscopie pour la détection et la quantification des parasites chez les hôtes et les vecteurs. Vous participerez également à la maintenance du système expérimental (travail en animalerie et insectarium), ainsi qu’à la réalisation des expérimentations en collaboration avec d’autres membres de l’équipe.

Compétences requises :

- Connaissance des principales techniques de biologie moléculaire et de microscopie appliqués à la parasitologie (PCR, qPCR, rt-qPCR, microsatellites, séquençage, génotypages).

- Une partie importante du projet ANR EVOMALWILD implique une approche de génomique comparative. Des connaissances sur les nouvelles techniques de séquençage (MinION, PacBio) et en bioinformatique seraient utiles.

- Expérience pratique en laboratoire, de préférence dans le domaine des interactions hôte-vecteur-parasite (infections expérimentales,  suivi de traits d’histoire de vie).

- Autonomie, sens de l’organisation et gestion du temps de travail.

Pour plus d’infos sur le poste, sur notre équipe ou sur les projets sur lesquels nous travaillons (ou pour n’importe quelle autre question) n’hésitez pas à me contacter .

Contact :  This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Si vous êtes intéressé(e), merci de m’envoyer par mail, avant le 15 Octobre 2019 :

- Votre CV (court svp, 2-3 pages max)

- Une petite lettre de motivation (1 page) expliquant votre parcours et vos aspirations professionnelles.

- Le nom et l’adresse mail de 2 personnes qui connaissent bien votre travail (un ancien prof, ou employeur par exemple), en bien spécifiant quelle est votre relation professionnelle avec eux.

 

 

 

18-months postdoc position in Mathematical/Computational modeling applied to theoretical evolutionary epidemiology

 

A 18-months postdoc position in applied mathematics is available at IRD in Montpellier (www.mivegec.ird.fr). The successful candidate will be involved in a multidisciplinary project funded by the ANR. The position will start as soon as possible. Support is for 18 months with a basic gross salary from 2150 to 2500 €/month, depending on experience. The project is aiming to develop Mathematical/Computational models to evaluate how genetic and environmental influences on mosquito-Plasmodium transmission strategies can shape disease dynamic and how control programs can influence the evolution of mosquito-Plasmodium transmission strategies.

 

Background: The successful candidate will collaborate with a team of applied mathematicians with a strong experience in Mathematical/Computational modeling of infectious diseases and a team of biologists with a strong background in epidemiology and evolutionary biology, both at the research unit MIVEGEC (CNRS, IRD) Montpellier.

Assessing the relative importance of environmental and genetic determinants in shaping parasite development duration within their insect hosts using Plasmodium falciparum and its major mosquito vectors Anopheles coluzzii and An. gambiae is a key factor to evaluate the risk of emergence and the transmission of malaria (Lefèvre et al., Evolutionary Applications, 2018). In turn, this implies to model both the spread of mosquito vectors in a heterogeneous environment (heterogeneity= hosts diversity + insecticide exposure, ....) and the dynamics of its adaptation to this heterogeneous environment. The model developed will help to understand (i) the consequences for the disease dynamic and (ii) the evolutionary consequences for the disease control. The candidate will first review the existing literature and then devise a mathematical model describing the evolutionary dynamics of mosquito vectors in a heterogeneous environment. This model will be fitted to field and experimental data currently collected in Burkina Faso by biologists of the team. Simulations of this model, coupled with an optimal control or viability approach, will yield practical insights on the disease control in the host population.

Required skills:
- Strong experience in numerical simulations of models.
- Experience in mathematical modeling (including ODE and PDE).
-Additional knowledge in optimal control (or viability) theory as well as an experience in epidemiology or evolutionary modeling are not necessary but will be considered positively.
- Ability to work in an interdisciplinary project involving mathematicians and biologists.

Contact:

Ramsès Djidjou-Demasse (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.) and Marc Choisy (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.).

The position is available from now and will remain open until a successful candidate is found.

 

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Call for research proposals on Genomics of human infectious diseases


The increased availability and decreased cost of sequence data is transforming research in epidemiology and public health. For instance, the ebola outbreak in West Africa in 2014-2016 has led to a rapid and massive production, and sharing, of throusands of virus full genomes sequences. What is true for microbial genomics is also becoming true for human genomics. Recently, the UK biobank has released a database including more than 100,000 human genomes. The availability of these genomes has implications from epidemiology (understanding how microbes spread) to immunology (identifying candidate genes for vaccines or  treatments).

MIVEGEC (Montpellier, France) is a leading research unit in Europe working on the ecology and evolution of infectious diseases. It has strong expertise in vector-borne diseases, mathematical modeling and virus evolution. The department is looking for a young research to set up a team on human and/or microbial genomics with implications on public health.

The department calls for applications (see details below) to elaborate a proposal to be submitted to the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM). If selected by the FRM, the applicant will be awarded a 200k€ grant in the first year to set-up his/her group and will have an option for a 100k€ grant the second year. This funding can be used for the PIs salary (if necessary), to hire a post-doctoral research fellow or engineer, and for consumables. In return, the department will provide access to its facilities, including the platforms (e.g. the IRD bioinformatics cluster). Applicants are also expected to apply for other types of funding by the end of the first year (ANR, ERC). Further details about the FRM application (in French) can be found here:


https://www.frm.org/chercheurs/appel-a-projets-frm/espoirs-de-la-recherche

Elligibility criteria

- Demonstrate early career achievement in genomics of human infectious diseases.
- At the deadline, hold a PhD for less than 7 years (career breaks will be taken into account).
- Not being currently supported by a significant independent grant (e.g. ERC, ATIP-Avenir, ANR Jeune Chercheur / Jeune Chercheuse).
- Demonstrate mobility throughout the scientific career.
- Demonstrate integration in international reserch networks.

Applications

Applicants should submit a 1-page CV, an exhaustive list of
publications, a research achivement statement (less than 5 pages) and a
research project (less than 5 pages). They can also add up to two
recommendation letters.

3 to 5 applicants will be selected to be interviewed by an international
panel in Montpellier

Importantly, success to this call does not guarantee success to the FRM
call. The applicant selected by MIVEGEC will only be allowed to apply to
the FRM.

Timing

- Deadline for the call: 10 July 2019
- Results for the pre-interview step: mid-August 2019
- Interviews in Montpellier: 11 September 2019

Contact

https://www.mivegec.ird.fr/en/

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