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Modélisation épidémiologique du COVID-19

 

Précisions

 

Ces rapports sont avant tout à des fins pédagogiques. Ils ne sauraient remplacer des instructions nationales et internationtales. En particulier, les hypothèses faites sont souvent volontairement simplificatrices pour plus de clarté.

Ce travail est réalisé par des modélisateurs et modélisatrices de l'équipe ETE du laboratoire MIVEGEC (CNRS, IRD, Université de Montpellier).

À ce jour ces travaux n'ont reçu aucun financement dédié et se veulent indépendants de toute entité publique ou privée.

Rapports

 

 

 

    • 24 mars 2020 : Rapport 3 sur un modèle de propagation de l'épidémie de COVID-19 (calcul de R0 et illustration des mesures de contrôle). Les fichiers bruts et les scripts R sont téléchargeable en format .zip

 

    • 30 mars 2020 : Rapport 4 sur l'analyse phylodynamique des génomes viraux (calcul de la date d'origine en France et de son temps de doublement). Les fichiers bruts et les scripts R sont téléchargeable en format .zip
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    • 07 avril 2020 : Rapport 5 sur les limites et délais dans l’estimation du nombre de reproduction en France. Les fichiers sources sont téléchargeable en archive .zip

 

    • 09 avril 2020 : Rapport 6 sur la phylodynamique du COVID-19 en France : variations temporelles de la croissance épidémique. Les fichiers sources sont téléchargeable en archive .zip

 

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    • 22 avril 2020 : Rapport 7 résumé, plus accessible pour un grand public, avec des scénarios de sortie de confinement. Les fichiers bruts sont téléchargeable en format .zip.
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    • 20 mai 2020 : Rapport 8, qui utilise des modèles stochastiques afin d'explorer la date d'origine de la vague épidémique ainsi que le nombre de jours qu'il faudrait attendre pour une disparition complète de l'épidémie.

 

    • 02 juin 2020: Rapport 9, Analyse de l’épidémie de COVID-19 en France et scénarios de contrôle.

Travaux scientifiques

 

    • [preprint] Ramsès Djidjou-Demasse, Yannis Michalakis, Marc Choisy, Mircea T. Sofonea, Samuel Alizon (2020) Optimal COVID-19 epidemic control until vaccine deployment [PDF]

 

Quelques liens utiles sur l'épidémiologie et l'évolution du COVID-19

 

L'équipe

Le groupe de modélisation de l'équipe ETE est composée de Samuel Alizon, Thomas Bénéteau, Marc Choisy, Gonché Danesh, Ramsès Djidjou-Demasse, Baptiste Elie, Yannis Michalakis, Bastien Reyné, Quentin Richard, Christian Selinger, Mircea Sofonea.